Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPIAP49247 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPIAP49247 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RPIAP49247 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPIAP49247 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RPIAP49247 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RPIAP49247 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPIAP49247 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPIAP49247 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPIAP49247 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPIAP49247 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPIAP49247 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RPIAP49247 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPIAP49247 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPIAP49247 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPIAP49247 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPIAP49247 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPIAP49247 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPIAP49247 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPIAP49247 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPIAP49247 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPIAP49247 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPIAP49247 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPIAP49247 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPIAP49247 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPIAP49247 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPIAP49247 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPIAP49247 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPIAP49247 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPIAP49247 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPIAP49247 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPIAP49247 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPIAP49247 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPIAP49247 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPIAP49247 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPIAP49247 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPIAP49247 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPIAP49247 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPIAP49247 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPIAP49247 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPIAP49247 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPIAP49247 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPIAP49247 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPIAP49247 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPIAP49247 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPIAP49247 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPIAP49247 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms