Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms