Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBRP36941 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBRP36941 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBRP36941 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBRP36941 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBRP36941 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBRP36941 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBRP36941 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBRP36941 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBRP36941 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBRP36941 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBRP36941 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBRP36941 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBRP36941 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBRP36941 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBRP36941 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBRP36941 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBRP36941 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBRP36941 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBRP36941 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBRP36941 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBRP36941 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBRP36941 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBRP36941 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBRP36941 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBRP36941 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBRP36941 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBRP36941 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBRP36941 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBRP36941 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBRP36941 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBRP36941 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBRP36941 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBRP36941 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBRP36941 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBRP36941 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBRP36941 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBRP36941 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBRP36941 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBRP36941 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBRP36941 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBRP36941 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBRP36941 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBRP36941 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBRP36941 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBRP36941 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBRP36941 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBRP36941 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBRP36941 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBRP36941 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBRP36941 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBRP36941 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBRP36941 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBRP36941 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBRP36941 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBRP36941 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBRP36941 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBRP36941 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBRP36941 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBRP36941 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBRP36941 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBRP36941 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBRP36941 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBRP36941 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBRP36941 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBRP36941 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBRP36941 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBRP36941 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBRP36941 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBRP36941 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBRP36941 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBRP36941 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBRP36941 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBRP36941 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBRP36941 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms