Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms