Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms