Protein–RNA interactions for Protein: P24863

CCNC, Cyclin-C, humanhuman

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNCP24863 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNCP24863 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNCP24863 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNCP24863 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNCP24863 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNCP24863 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNCP24863 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNCP24863 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNCP24863 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNCP24863 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNCP24863 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNCP24863 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNCP24863 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNCP24863 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNCP24863 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNCP24863 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNCP24863 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNCP24863 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNCP24863 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNCP24863 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNCP24863 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNCP24863 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNCP24863 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNCP24863 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNCP24863 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNCP24863 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNCP24863 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNCP24863 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNCP24863 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNCP24863 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNCP24863 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNCP24863 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNCP24863 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNCP24863 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNCP24863 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNCP24863 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNCP24863 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNCP24863 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNCP24863 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNCP24863 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNCP24863 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNCP24863 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNCP24863 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNCP24863 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNCP24863 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNCP24863 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNCP24863 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNCP24863 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNCP24863 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNCP24863 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNCP24863 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNCP24863 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNCP24863 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNCP24863 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNCP24863 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNCP24863 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNCP24863 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNCP24863 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNCP24863 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNCP24863 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNCP24863 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNCP24863 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNCP24863 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNCP24863 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNCP24863 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNCP24863 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNCP24863 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNCP24863 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNCP24863 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNCP24863 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNCP24863 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNCP24863 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNCP24863 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNCP24863 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNCP24863 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNCP24863 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNCP24863 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNCP24863 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNCP24863 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNCP24863 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNCP24863 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNCP24863 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNCP24863 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNCP24863 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNCP24863 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNCP24863 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNCP24863 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNCP24863 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNCP24863 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNCP24863 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNCP24863 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNCP24863 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNCP24863 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNCP24863 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNCP24863 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNCP24863 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNCP24863 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNCP24863 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNCP24863 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNCP24863 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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