Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PTPRZ1P23471 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PTPRZ1P23471 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PTPRZ1P23471 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PTPRZ1P23471 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PTPRZ1P23471 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PTPRZ1P23471 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PTPRZ1P23471 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PTPRZ1P23471 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PTPRZ1P23471 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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