Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2A2P16615 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms