Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA4P06727 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA4P06727 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA4P06727 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA4P06727 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA4P06727 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA4P06727 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA4P06727 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA4P06727 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA4P06727 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA4P06727 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA4P06727 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA4P06727 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA4P06727 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA4P06727 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA4P06727 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA4P06727 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA4P06727 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA4P06727 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA4P06727 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA4P06727 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA4P06727 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA4P06727 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA4P06727 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA4P06727 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA4P06727 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA4P06727 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA4P06727 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA4P06727 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA4P06727 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA4P06727 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA4P06727 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA4P06727 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA4P06727 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA4P06727 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA4P06727 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA4P06727 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA4P06727 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA4P06727 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA4P06727 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA4P06727 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA4P06727 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA4P06727 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA4P06727 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA4P06727 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA4P06727 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA4P06727 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA4P06727 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA4P06727 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA4P06727 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA4P06727 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA4P06727 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA4P06727 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA4P06727 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA4P06727 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA4P06727 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA4P06727 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA4P06727 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA4P06727 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA4P06727 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA4P06727 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA4P06727 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA4P06727 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA4P06727 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA4P06727 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA4P06727 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA4P06727 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA4P06727 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA4P06727 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA4P06727 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA4P06727 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA4P06727 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA4P06727 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA4P06727 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA4P06727 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA4P06727 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA4P06727 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA4P06727 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA4P06727 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA4P06727 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA4P06727 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA4P06727 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA4P06727 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA4P06727 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA4P06727 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA4P06727 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA4P06727 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA4P06727 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA4P06727 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA4P06727 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA4P06727 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA4P06727 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA4P06727 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA4P06727 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA4P06727 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA4P06727 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA4P06727 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA4P06727 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA4P06727 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA4P06727 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms