Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms