Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRC1O43663 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRC1O43663 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRC1O43663 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRC1O43663 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRC1O43663 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRC1O43663 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRC1O43663 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRC1O43663 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRC1O43663 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRC1O43663 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRC1O43663 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRC1O43663 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRC1O43663 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRC1O43663 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRC1O43663 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRC1O43663 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRC1O43663 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PRC1O43663 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRC1O43663 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRC1O43663 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRC1O43663 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PRC1O43663 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRC1O43663 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRC1O43663 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRC1O43663 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRC1O43663 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRC1O43663 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRC1O43663 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRC1O43663 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRC1O43663 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRC1O43663 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRC1O43663 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRC1O43663 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRC1O43663 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRC1O43663 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRC1O43663 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRC1O43663 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRC1O43663 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRC1O43663 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRC1O43663 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRC1O43663 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRC1O43663 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PRC1O43663 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRC1O43663 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRC1O43663 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRC1O43663 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRC1O43663 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms