Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRPO00591 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRPO00591 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRPO00591 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRPO00591 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRPO00591 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRPO00591 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRPO00591 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRPO00591 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRPO00591 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRPO00591 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRPO00591 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRPO00591 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRPO00591 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRPO00591 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRPO00591 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRPO00591 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRPO00591 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRPO00591 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRPO00591 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRPO00591 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRPO00591 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRPO00591 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRPO00591 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRPO00591 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRPO00591 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRPO00591 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRPO00591 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRPO00591 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRPO00591 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRPO00591 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRPO00591 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRPO00591 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRPO00591 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRPO00591 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRPO00591 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRPO00591 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRPO00591 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRPO00591 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRPO00591 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRPO00591 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms