Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

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Length 3,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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