Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
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