Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 219.2 ms