Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms