Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms