Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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SNX6Q9UNH7 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SNX6Q9UNH7 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SNX6Q9UNH7 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SNX6Q9UNH7 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SNX6Q9UNH7 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SNX6Q9UNH7 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SNX6Q9UNH7 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SNX6Q9UNH7 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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