Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms