Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms