Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms