Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms