Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SH3BP4Q9P0V3 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SH3BP4Q9P0V3 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SH3BP4Q9P0V3 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SH3BP4Q9P0V3 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SH3BP4Q9P0V3 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SH3BP4Q9P0V3 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SH3BP4Q9P0V3 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SH3BP4Q9P0V3 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SH3BP4Q9P0V3 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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