Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms