Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms