Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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