Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms