Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 KIAA1614-202ENST00000367588 9654 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms