Protein–RNA interactions for Protein: Q96JT2

SLC45A3, Solute carrier family 45 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC45A3Q96JT2 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms