Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms