Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms