Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 286.3 ms