Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms