Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF182Q8N6D2 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms