Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CLIP4Q8N3C7 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CLIP4Q8N3C7 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CLIP4Q8N3C7 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CLIP4Q8N3C7 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CLIP4Q8N3C7 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CLIP4Q8N3C7 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CLIP4Q8N3C7 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CLIP4Q8N3C7 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CLIP4Q8N3C7 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CLIP4Q8N3C7 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CLIP4Q8N3C7 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CLIP4Q8N3C7 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CLIP4Q8N3C7 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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