Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2A0

LINC00269, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00269, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00269Q8N2A0 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms