Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms