Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NLRP13Q86W25 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NLRP13Q86W25 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NLRP13Q86W25 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NLRP13Q86W25 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NLRP13Q86W25 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NLRP13Q86W25 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP13Q86W25 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP13Q86W25 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP13Q86W25 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP13Q86W25 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP13Q86W25 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP13Q86W25 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP13Q86W25 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP13Q86W25 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP13Q86W25 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP13Q86W25 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP13Q86W25 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP13Q86W25 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP13Q86W25 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP13Q86W25 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP13Q86W25 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP13Q86W25 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP13Q86W25 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP13Q86W25 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP13Q86W25 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP13Q86W25 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP13Q86W25 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP13Q86W25 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP13Q86W25 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP13Q86W25 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP13Q86W25 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms