Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms