Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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