Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SUMO4Q6EEV6 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms