Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CREB3L3Q68CJ9 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CREB3L3Q68CJ9 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CREB3L3Q68CJ9 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CREB3L3Q68CJ9 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CREB3L3Q68CJ9 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CREB3L3Q68CJ9 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CREB3L3Q68CJ9 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CREB3L3Q68CJ9 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CREB3L3Q68CJ9 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CREB3L3Q68CJ9 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CREB3L3Q68CJ9 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CREB3L3Q68CJ9 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CREB3L3Q68CJ9 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CREB3L3Q68CJ9 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CREB3L3Q68CJ9 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CREB3L3Q68CJ9 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CREB3L3Q68CJ9 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms