Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

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Length 2,430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 SMIM28-201ENST00000573100 855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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FAM208BQ5VWN6 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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FAM208BQ5VWN6 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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FAM208BQ5VWN6 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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FAM208BQ5VWN6 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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