Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms