Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ARFIP2-210ENST00000614314 3846 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PCSK1-202ENST00000508626 2234 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 F2RL3-201ENST00000248076 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 GLT8D2-201ENST00000360814 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ALDH1L1-202ENST00000393431 2797 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 COG4-202ENST00000393612 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RNF219-AS1-209ENST00000606429 2418 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 BTNL8-202ENST00000340184 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 HYLS1-202ENST00000425380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CACNA2D3-AS1-201ENST00000471265 2078 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SLC44A4-210ENST00000544672 2634 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 DFFB-205ENST00000378209 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 APBB1-223ENST00000618005 2107 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AL359641.1-201ENST00000412509 1558 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ENDOV-203ENST00000517795 2548 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 VWA5B2-201ENST00000273794 3486 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 BSCL2-206ENST00000405837 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LINC02473-201ENST00000569621 2195 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NOSTRIN-203ENST00000397209 1437 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RPS6KA1-220ENST00000531382 2359 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms