Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms