Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.2 ms