Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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