Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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