Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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VPS72Q15906 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
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